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https://www.abbs.info ISSN 0582-9879 |
Identification
of Interaction and Interaction Domains between Neuroglobin and Na+,
K+-ATPase beta2 Subunit
XU Wen-Lin1,2,
WANG Chun-Li1, LIAO Zhi-Yong1, ZHANG Yong-Liang1,
YU Li-Hong1, MENG Fan-Wei1, WANG Xin-Xing2,
YIN Zhao-Yun2, QIAN Ling-Jia2, ZHANG Cheng-Gang1
( 1Beijing Institute of Radiation Medicine,
Beijing 100850, China; 2Institute of Hygiene and Environment
Medicine, Tianjin 300050, China )
Abstract The
pre-transformed human fetal brain cDNA library was used to screen the protein
interacting with neuroglobin by using yeast two hybrid system III from ClonTech
Inc.. The protein encoded by one of the clones interacting with neuroglobin
(NGB) was confirmed to be the C terminus of the Na+, K+-ATPase
beta2 subunit (NKA1b2) based on amino acid sequences. Then the full-length
coding region cDNA sequence of NKA1b2 was obtained from human fetal brain cDNA
library by PCR. A set of experiments were designed to test the interaction
between NGB and NKA1b2. Interaction between NGB and NKA1b2 was confirmed by
binding assay in vitro. Furthermore, the interaction was also proved by
co-immunoprecipitation test in vivo. Moreover, the structure integrity of
neuroglobin was found to be essential for the interaction between NGB and
NKA1b2 by yeast two hybrid method with a series of neuroglobin truncated
mutants.
Key words neuroglobin(NGB);
Na+, K+-ATPase; yeast two hybrid system; protein
interaction; co-immunoprecipitation
脑红蛋白与Na+,K+
-ATP酶β2亚基的相互作用及作用位点的鉴定
徐文琳1,2 王春丽1 张永亮1 廖志勇1 余利红1 孟凡伟1 王新兴2 尹昭云2 钱令嘉2 张成岗1*
(1军事医学科学院放射医学研究所, 北京 100850;2军事医学科学院卫生学与环境医学研究所, 天津 300050 )
摘要 为研究神经系统特异性携氧蛋白――脑红蛋白(NGB)保护神经元耐受缺氧损伤的分子机制, 利用酵母双杂交系统从人胎脑cDNA文库中筛选与其有相互作用的蛋白质。 序列分析表明, 其中一个克隆的编码产物与Na+,K+-ATP酶β2亚基(NKA1b2)序列一致。 随后采用PCR方法从人胎脑cDNA文库中扩增获得NKA1b2全长cDNA。
蛋白质结合实验表明, 原核表达的NGB与体外转录翻译得到的NKA1b2在细胞外有结合作用。 免疫共沉淀实验证明二者在生理条件下能够以复合物的形式存在。
利用NGB系列短截体研究相互作用的位点发现, NGB蛋白N末端1~75位氨基酸可与NKA1b2结合, 但结合力很弱, 而其C末端75个氨基酸则与NKA1b2无结合作用, 由此推测NGB蛋白整体的三维结构是结合所必需的。
关键词 脑红蛋白; Na+,K+-ATP酶; 酵母双杂交系统; 蛋白质相互作用; 免疫共沉淀
脑红蛋白(neuroglobin, NGB)是新近发现的体内第三类重要的携氧蛋白质, 能够特异性地向脑组织供氧, 在神经系统氧摄取、氧运输和氧利用等生理过程中起重要作用,
预计将在临床脑梗塞、中风等脑缺氧相关疾病的研究及治疗方面具有重要作用[1~4]。
Greenberg等[5]的研究表明, 提高体外培养神经元中NGB的表达量之后, 显著增强细胞抗缺氧的能力;
反义核酸封闭NGB的表达, 则导致细胞对缺氧损伤更为敏感。
这表明缺氧增强NGB的表达, 有助于保护神经元耐受缺氧损伤。
本实验室一直在关注脑缺氧损伤的分子机制, 曾率先获得人脑红蛋白全长cDNA序列[6]和大鼠脑红蛋白基因编码区的cDNA序列[7,8],
并根据此序列设计引物, 采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对大鼠缺氧缺血性脑损伤时脑组织中脑红蛋白mRNA水平的变化进行动态研究, 发现缺氧缺血性脑损伤时脑组织中该基因的表达显著升高, 提示该基因可能在脑缺氧的适应性调节过程中起重要作用[9]。 为了深入探讨这种保护作用的分子机制,
本研究采用酵母双杂交系统, 希望能够筛选到与它相互作用的分子,
为阐明其保护机制提供重要的线索和启示。 本文报道从预转化的人胎脑cDNA文库中筛选到Na+,K+-ATP酶β2亚基(NKA1b2)与脑红蛋白以复合物的形式存在。
随后克隆了NKA1b2的编码区全长cDNA, 通过细胞外蛋白质结合实验进一步验证二者的相互作用,
免疫共沉淀实验证明二者在生理状态下以复合物形式存在。 这些结果提示NGB有可能通过对Na+,K+-ATP酶所具有的离子环境内稳态(ion homeostasis)的调节功能发挥神经元保护作用, 从而为NGB所具有的神经保护功能分子机制的阐明提供了重要线索。
1 材料和方法(Materials and
Methods)
1.1 文库、菌株、质粒和试剂
预转化的人20~25周孕龄胎脑cDNA文库、酵母菌株AH109、质粒pGBKT7均购自Clontech公司; pGEX-4T-2载体购自Amersham Pharmacia公司, pGEX-4T-2-NGB由本实验室李林构建; pGEM-T载体购于Promega公司; 大肠杆菌BL21(DE3)为本实验室保存。 所需的限制性内切酶, LA Taq DNA聚合酶、T4 DNA连接酶均购自TaKaRa公司; 酵母用培养基、酵母转化试剂盒、X-gal均购自Clontech公司; 酸洗玻璃珠购自Sigma公司; TNT体外转录试剂盒购于Promega公司; GST融合表达蛋白纯化树脂谷胱甘肽Sepharose 4B、IPTG和L-[35S] Met购自Amersham Pharmacia公司; 免疫沉淀试剂盒、蛋白酶抑制剂购自Roche公司; 化学发光底物试剂ECL试剂盒为Santa Cruz公司产品; NGB单克隆抗体和NKA1b2多克隆抗体为本实验室自制。
1.2 质粒构建
本实验室获得的小鼠NGB基因, 利用经PCR引入的SmaI和SalI双酶切位点定向亚克隆至pGBKT7, 形成pGBKT7-NGB; PCR扩增NGB的系列短截体ΔN1-15、ΔN1-40、ΔN1-60、ΔN1-75、ΔC136-151、ΔC111-151、ΔC91-151、ΔC76-151, 利用酶切位点SmaI和SalI亚克隆至pGBKT7, 用于酵母双杂交的验证。 用NKA1b2上游引物pU331:
5′-CATGCAT-GCATGGTCATCCAGAAAGAG-3′(斜体为SphI酶切位点)和下游引物pD332:
5′-ACGCGTCGACTCAG-GTTTTGTTGATGC-3′(斜体为SalI酶切位点),从人胎脑cDNA文库中扩增NKA1b2编码区全长cDNA(870 bp), 利用酶切位点SphI和SalI亚克隆至pGEM-T载体; 用上游引物pU331:
5′-CATGCAT-GCATGGTCATCCAGAAAGAG-3′(斜体为SphI酶切位点)和下游引物pD351: 5′-ACGCGTCGACTCA-GATGACCCGGTTC-3′(斜体为SalI酶切位点),
扩增NKA1b2 N端1~186位氨基酸编码区, 连入pGEM-T载体, 用于体外转录翻译; 用上游引物pT7-Hatag:
5′-AAAATTGTAATACGACTCACATTAG-GGCGAGCCGCCACCATGGCTTACCCATAC-3′和下游引物Ypd: 5′-CACTTGAACGCCCCAAAAAGTCATAGAATGCT-3′, 以筛库获得的质粒pACT2-NKA1b2-C为模板, 扩增NKA1b2的 C端187~290位氨基酸编码区, 获得的PCR产物直接用于体外转录翻译。
1.3 酵母双杂交筛选
采用醋酸锂法将酵母双杂交系统中的重组诱饵载体pGBKT7-NGB转化至酵母菌株AH109, 涂布于SD/-Trp/X-gal、SD/-Trp/-His/X-gal、SD/-Trp/-Ade/X-gal, 鉴定转录激活活性。 与预转化构建于pACT2载体的人胎脑cDNA文库共温育杂交, 涂布于SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade/X-gal平板上。
30 ℃培养至菌落长出(7~20天)。
玻璃珠法提取酵母阳性克隆的质粒, 采用电转化法,
将之导入大肠杆菌JM109, 筛选含有插入片段的阳性克隆,
测序分析鉴定。 经生物信息学分析确定插入的基因。
1.4 GST-NGB的诱导表达及纯化
将转化有pGEX-4T-2和pGEX-4T-2-NGB质粒的BL21(DE3)菌株, 经0.1 mmol/L IPTG 30 ℃诱导4 h,
收集菌体, 超声破碎, 收集上清液。 加入谷胱甘肽Sepharose 4B中, 室温下摇床100 r/min温育30 min, 弃上清液, PBS洗去非特异结合的杂蛋白质, 加入还原型谷胱甘肽洗脱液, 室温下摇床100 r/min温育20 min, 取上清液,
获得纯化的GST和GST-NGB。
1.5 细胞外蛋白质结合实验[10]
分别取500 μl GST和GST-NGB原核表达上清液, 加入50 μl柱床体积的谷胱甘肽Sepharose 4B中, 洗去未结合的蛋白质, 加入体外转录翻译得到的1~10 μl 35S标记的NKA1b2全长、N端和C端各片段, 4 ℃过夜。 洗去未结合的蛋白质, 加入6×SDS上样缓冲液, 99 ℃变性7 min, 使复合物解离。 取解离上清液进行浓度为12.5%的SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳,
干胶, 压X光片, -80 ℃曝光, 显影。
1.6 免疫共沉淀
取一只出生3天乳鼠大脑皮层, 加1 ml细胞裂解液,
匀浆处理, 4 ℃轻摇1 h, 12 000 r/min离心10 min, 取上清液加入对照IgG, 20 μl 蛋白A琼脂糖, 4 ℃摇1 h, 12 000 r/min离心20 s,
取上清液加入NKA1b2多抗, 4 ℃摇1 h,
加50 μl蛋白A琼脂糖, 4 ℃摇过夜, 12 000 r/min离心20 s,
沉淀用细胞裂解液重复洗4次, 加20 μl 2×SDS上样缓冲液, 99 ℃变性7 min。 进行浓度为12.5%的SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳, 转移至PVDF膜上, 4 ℃封闭过夜, 用NGB单抗检测免疫沉淀复合物中是否存在NGB。
1.7 相互作用位点的鉴定
将构建于pGBKT7的NGB及系列缺失短截体的重组载体, 分别与pACT2-NKA1b2重组载体, 采用醋酸锂法共转化至酵母菌株AH109, 涂布于SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade/ X-gal平板上, 30 ℃培养至菌落长出(7~20天), 以确定有无相互作用。
2 结果(Results)
2.1 酵母双杂交筛选及鉴定
重组质粒pGBKT7-NGB转化酵母菌株AH109, 涂布于SD/-Trp、SD/-Trp/-His、SD/-Trp/-Ade平板, 并检测β-半乳糖苷酶活性,
结果表明NGB在该酵母系统中无转录激活活性, 可作为诱饵蛋白质利用酵母双杂交系统筛选文库。
经过筛选, 得到58个阳性克隆, 采用玻璃珠法提取酵母质粒,
电转化至大肠杆菌JM109, 测序鉴定插入片段。 采用自编的读码框分析程序(ORF finder)分析测序结果, 并使用ClustalW程序进行蛋白质同源序列比对分析。
结果发现, 编号为jky2167的克隆所编码的氨基酸序列与人Na+,K+-ATP酶β2亚基(NKA1b2)的187~290位氨基酸一致(图1)。
